中科大计算机科学与技术学院
中国科技大学于1958年建校时就设置了计算机专业，老一辈计算机科学家夏培肃先生等亲自执教，创办之初，与中科院计算所合作自主设计并研制成功了我国第1台通用计算机--107机并于1960年安装于中国科大、1975年研制成功小型机KD-3，1983年与中科院计算所联合研制成功了功能分布式阵列处理机系统GF10系列，1983年研制成功了微型机KD-4和KD-5并于次年转让给湖北无线电二厂投入生产。
1982年成立了计算机科学技术系, 与中科院计算所联合培养了国内首批博士。1990年获得计算机软件博士学位点；1995年成立了我国的第1个国家高性能计算中心；2000年获计算机科学与技术一级学科博士学位授予权，并建立博士后流动站，该学科是中国科学院博士生重点培养基地；2007年我系计算机软件与理论专业经教育部评审为国家重点学科。2009年3月计算机科学与技术学院正式成立。
软件学院
中国科学技术大学软件学院是国家教育部和国家计委首批批准设立的示范性软件学院之一。目前，软件学院已与微软、IBM、HP、思科、阿尔卡特朗讯、中国科学院计算所和科大讯飞等许多国内外著名研究院所和IT企业建立了长期的合作关系，以不断改进课程设置和教学内容。学院在北京、上海、深圳、合肥和苏州等地的近50家知名软件企业和日本软件企业建立了实习基地，并与英国伯明翰大学合作办学，建立了联合培养软件工程硕士计划。在培养模式和教学方法上进行了大胆改革，以强化实践和外语能力，提高综合开发和管理能力。已逐步形成“高质量、重实践、厚基础、宽视野”的办学特色。
