第一步，将资产负债表的期初数和期末数过人工作底稿的期初数栏和期末数栏。
第二步，根据医院经济业务的特点，将医院各项经济业务产生或运用的现金流量分为：医疗活动、投资活动、筹资活动现金流量。对核算期业务进行分析并编制调整分录。编制调整分录时，以收入支出总表的项目为基础，从“医疗收入”、“药品收入”开始，结合资产负债表项目的借、贷方发生额、余额及实际发生的经济业务，编制调整分录如下：
（1）分析调整“医疗收入”、“药品收入”。
（2）分析调整“其他应收款”。
（3）分析调整“其他收入——培训收入”、“其他收入——救护车收入”、“其他收入——利息收入”、“其他收入——废品变价收入”。
（4）分析调整“医疗支出——公用支出”、“药品支出——公用支出”、“待摊费用”、“预提费用”、“坏账准备”、开办费及无形资产的摊销、“专用基金”、“应付工资”、“应付社会保障费”、“药品进销差价”借方发生额、“药品”贷方发生额。借记“医疗支出——公用支出”、“药品支出 ——公用支出”、“待摊费用”、“药品进销差价”，贷记“医疗活动现金流量——开展医疗活动支出的现金”、“专用基金”、“开办费”、“无形资产”、“药品”、“库存物资”、“预提费用”、“坏账准备”、“应付工资”、“应付社会保障费”、“固定基金”、“待处理流动资产净损溢”。
（5）分析调整“药品”借方发生额、“库存物资”、“在加工材料”、“应付账款”、“其他应付款”、“药品进销差价” 贷方发生额
（6）分析调整“医疗支出——人员支出及对个人和家庭补助支出”、“药品支出——人员支出及对个人和家庭补助支出”。
（7）分析调整“其他支出”、从“管理费用——公用支出”结转至“医疗支出——公用支出”、“药品支出——公用支出”的数额。
（8）分析调整“应缴超收款”。借记“应缴超收款”，贷记“医疗活动现金流量——上缴药品超收款支出的现金”。
（9）分析调整收回对外投资及投资收益。
（10）分析调整处置固定资产收到的现金
（11）分析调整医院用现金购人的“无形资产”、“开办费”。
（12）分析调整“对外投资”。
（13）分析调整“固定资产”。
（14）分析调整“在建工程”。
（15）分析调整50万元以上的大型维修支出。
（16）分析调整“财政补助收入”、“上级补助收入”。借记“筹资活动现金流量——补助收入所收到的现金”，贷记“财政补助收入”、“上级补助收入”。
（17）分析调整“其他收入——捐赠收入”。借记“筹资活动现金流量——接受捐赠所收到的现金”，贷记“其他收入——捐赠收入”。
（18）分析调整“长期借款”、“短期借款”。借记“筹资活动现金流量——借款所收到的现金”，贷记“长期借款”、“短期借款”。此项“借款所收到的现金”调整金额＝“长期借款”贷方发生额＋“短期借款”贷方发生额。。
（19）分析调整“财政专项支出”。
（20）分析调整待处理固定资产净损溢。
（21）结转收支。
（22）提取职工福利基金、事业发展基金。借记“结余分配——待分配结余”，贷记“专用基金”、“事业基金”。
（23）最后调整现金净变化额。
另外，需要注意有的科目如“应付账款”既可能在医疗活动中产生，也可能在投资活动中产生，本文一概作为医疗活动处理，在实际工作中应根据实际情况严格区分。
第三步，将调整分录过人工作底稿的相应部分，核对调整分录借方、贷方合计数相等；核对资产负债表项目期初数加减调整分录中的借贷金额后，应等于资产负债表项目期末数；收入支出总表项目当期发生额与收入支出总表数据相符。
第四步，根据工作底稿中的现金流量表项目编制正式的现金流量表
