吉林大学是由东北人民大学发展而来的。1952年院系调整时，从清华大学、北京大学等院校调入余瑞璜、朱光亚、吴式枢、芶清泉、霍秉权、郑建宣、高墀恩等一批著名的专家、教授，建立了东北人民大学物理系。1958年东北人民大学更名为吉林大学。随着物理学的发展，一些分支不断地形成新的学科、尖端科技。为适应国家建设对人才的需要，原吉林大学在物理系及兄弟系一些专业的基础上先后建立了半导体系（并校后为电子科学与工程学院）、计算机科学系（并校后为计算机科学与技术学院）、原子与分子物理研究所、超硬材料国家重点实验室、材料科学系（并校后为材料科学与工程学院）和测试科学实验中心。2001年4月，原吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学和长春邮电学院等五所院校的物理系（室）合并为吉林大学物理学院。
　　学院下设4个系和5个中心，分别是凝聚态物理系、光信息科学与技术系、应用物理系、声学与微波物理系和物理实验中心、公共物理教学与研究中心、理论物理研究中心、物理实验中心、原子核科学与技术研究中心、物理应用开发中心。
　　物理学院在学科专业建设方面取得了令人瞩目的成绩，成为物理学界的佼佼者。1985年国务院学位委员会批准吉林大学物理学院建立“首批物理学博士后科研流动站”；1986年我院的凝聚态物理学专业被教育部评定为"国家重点学科专业"；1993年我院的物理学科被教育部确定为"国家理科基础科学研究和教学人才培养基地"，1997年我院物理学科被国家学位委员会评定为"一级学科博士学位授予单位"，即吉林大学物理学院对物理学一级学科所包含的理论物理学、光学、声学、磁学、凝聚态物理学、原子与分子物理学、原子核物理与粒子物理学、等离子体物理学等全部八个专业有博士学位授予权；此外，光学工程、电磁场与微波技术、测试计量技术与仪器等三个专业有硕士学位授予权。1998年我院的凝聚态物理学专业、光电子和光学专业被教育部确定为"211工程"重点学科专业。2001年原子相干与原子分子光谱实验室被教育部评定为重点实验室。在211工程、世界贷款项目、国家级科研和人才培养基地经费以及学校1000万学科建设经费的支持下，实验仪器设备有很大改观，例如，OPO激光系统和YAG系统的染料激光器等先进设备，与国际同类实验室接轨。